Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP2O94887 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP2O94887 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP2O94887 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP2O94887 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP2O94887 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP2O94887 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP2O94887 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP2O94887 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP2O94887 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP2O94887 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms