Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC45O75419 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC45O75419 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC45O75419 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC45O75419 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC45O75419 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC45O75419 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms