Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX16O60231 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX16O60231 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX16O60231 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX16O60231 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX16O60231 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX16O60231 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms