Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR3O43761 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms