Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA2O43364 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms