Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD8O14715 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD8O14715 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms