Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C0C1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C0C1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C0C1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C0C1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H7C0C1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H7C0C1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H7C0C1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H7C0C1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H7C0C1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H7C0C1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms