Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD1CA8MV81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms