Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf47A7E2U8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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