Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRM3A6NNA2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms