Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AUP1Q9Y679 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms