Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNEQ9Y223 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms