Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1024Q9UPX6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1024Q9UPX6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms