Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG5Q9UPR3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG5Q9UPR3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms