Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MED23Q9ULK4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED23Q9ULK4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms