Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ADAM28Q9UKQ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ADAM28Q9UKQ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms