Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNL1Q9UK58 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNL1Q9UK58 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms