Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSKSQ9UJT2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms