Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRRQ9UBK8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTRRQ9UBK8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms