Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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CLDND1Q9NY35 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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