Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms