Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms