Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms