Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSG101Q99816 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSG101Q99816 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms