Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHP1Q99653 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms