Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SORCS2Q96PQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms