Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC7Q96NW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms