Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR1Q96JP9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms