Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms