Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms