Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP4CQ96CF2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms