Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLP1Q92989 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms