Protein–RNA interactions for Protein: Q92988

DLX4, Homeobox protein DLX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX4Q92988 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DLX4Q92988 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLX4Q92988 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms