Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms