Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF516Q92618 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF516Q92618 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms