Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPDL3AQ92484 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms