Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38AQ8NAV1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms