Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00469Q8N7U9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00469Q8N7U9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00469Q8N7U9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms