Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCL2Q8N4E4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL2Q8N4E4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms