Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms