Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms