Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEPROQ6NW34 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms