Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms