Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D1BQ5T0F9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms