Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHC1Q5JVL4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms