Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ESCO2Q56NI9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ESCO2Q56NI9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms