Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM71Q2Q1W2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms