Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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