Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF1Q15637 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF1Q15637 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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