Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERBB4Q15303 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERBB4Q15303 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms